Если вы отчаиваетесь из-за отсутствия приложений для управления окнами, доступных в OS X, тогда Afloat может быть тем, что вы ищете - по крайней мере, для приложений Cocoa. Afloat гарантирует, что ваши окна останутся на плаву поверх всех...